Setalah mengalami pengunduran, Kongres PSSI akhirnya akan di gelar. Kongres PSSI sebenarnya dijadwalkan pada tanggal 17 Oktober 2016 di Makassar. Tetapi ada satu hal yang menjadi problem gagalnya penyelenggaraan kongres tersebut. Yaitu karena masalah tempat.
Pihak kelopisian hanya bisa mengizinkan digelar dengan syarat mendapatkan rekomendasi dari Menpora. Dan Menpora sendiri merekomendasikan tempat kongres di Jogja. Karena menurut Menpora, Imam Nahrawi, Jogja merupakan tempat berdirinya organisasi sepak bola tertinggi di Indonesia tersebut.
Dan FiFA sendiri memberi tenggang waktu sampai tanggal 10 November. Dan pada tanggal tersebutlah kongres yang gagal tersebut akan di gelar. Dan dibritakan Kongres PSSI tersebut akan digelar di Hotel Mercure, Ancol. Dan agenda kongres tersebut adalah memilih Ketua Umum PSSI dan Anggota Exco PSSI periode 2016-2020.